رجع الى العراق سنة 1286، وهي السنة التي توفي فيها شيخه الطهراني.

وفي هذه الفترة سافر الى الحج مرة ثانية، ورجع الى النجف الأشرف وأقام فيه.

ثم هاجر الى سامراء في سنة ملتحقاً باستاذه المجدد الشيرازي وهو اوّل المهاجرين اليها.

يقول النوري:

" الى أن ساعدني التقدير الى المهاجرة الى الناحية المقدسة سرّ من رأى لمّا هاجر اليها السيد السند حجة الاسلام، ونادرة الأيام، واستاد ائمة البشر، ومجدد المذهب في القرن الثالث عشر، المنتهى اليه رئاسة الشيعة في عصره، والمطاع الذي انقاد له الجبابرة لنهيه وأمره...

الآميرزا محمد حسن الشيرازي ".

وفي هذه الفترة رزق الحج للمرة الثالثة.

قال النوري (رحمه الله) بعد أن تحدّث عن هجرته الى سامراء: " وبقيت فيها سنين ورزقني الله تعالى فيها الحج ثالثاً ".

ولما رجع من حجه هذا سافر الى ايران للمرة الثالثة في سنة وزار مشهد الامام الرضا عليه السّلام.